A Pró-reitoria de Pesquisa e Inovação tem como objetivo principal incentivar as atividades de pesquisa desenvolvidas pelos servidores e discentes do IF Sudeste MG. A Propesqinov organiza e regulamenta as atividades de pesquisa, pós-graduação e Inovação por meio do Comitê de Pesquisa e do Núcleo de Inovação e Transferência de Tecnologia.
Para registrar as ações desenvolvidas nos Campi do IF Sudeste MG utilizaremos o Sistema de Gestão da Pesquisa, que está em construção e pode ser aperfeiçoado.